DNA mikroarrayleri aynı anda binlerce gen ve bunlara ait ifade seviyelerinin kantitatif analizlerine olanak sağlamaktadır. Affymetrix GeneChip Mikroarray deneyleri çeşitli organizmalardan elde edilen farklı dokulardaki gen ifade düzeylerini, gen kopya sayılarını ve SNP'leri tayin etme amacıyla kullanılır. Gen ifade düzeyi çalışmalarında temel kural, total RNA popülasyonundaki her mRNA molekülü için bu moleküle eşlenik olan tek iplikli işaretlenmiş bir cDNA hazırlamaktır. Problar, genellikle işaretli nükleotidlerin varlığında mRNA'nın tek iplikli cDNA'ya ters transkripsiyonu ile üretilir.

DNA mikroarrayleri aynı anda binlerce gen ve bunlara ait ifade seviyelerinin kantitatif analizlerine olanak sağlamaktadır. Affymetrix GeneChip Mikroarray deneyleri çeşitli organizmalardan elde edilen farklı dokulardaki gen ifade düzeylerini, gen kopya sayılarını ve SNP'leri tayin etme amacıyla kullanılır. Gen ifade düzeyi çalışmalarında temel kural, total RNA popülasyonundaki her mRNA molekülü için bu moleküle eşlenik olan tek iplikli işaretlenmiş bir cDNA hazırlamaktır. Problar, genellikle işaretli nükleotidlerin varlığında mRNA'nın tek iplikli cDNA'ya ters transkripsiyonu ile üretilir.

Cihazlar: Applied Biosystems GeneAmp® PCR System 9700

GeneAmp® PCR System 9700 Polimeraz Zincir Reaksiyonu (Polymerase Chain Reaction, PCR) yöntemi ile nükleik asitlerin yükseltgenme işleminin otomatik olarak gerçekleştirilmesi için dizayn edilmiş bir cihazdır.

Özellikleri

Cihaz: Stuart Scientific , Model S102HS

Hibridizasyon fırını, Southern/Northern hibridizasyon ve DNA Fingerprinting çalişmalarında kullanılmaktadır. Sistem hibridizasyona hazır membran ve problar ile kullanılabilir.

Gerçek Zamanlı PCR kalitatif ve kantitatif sonuç veren ve çok yaygın olarak kullanılan bir PCR metodudur. Son ürün analizine dayanan Klasik PCR'ın aksine bu sistemler reaksiyonun gerçekleştiği zamanla eş zamanda reaksiyonu görüntüler. Bu gibi sistemlerdeki PCR reaksiyonunda, ardı ardına gerçekleşen döngülerde üretilen PCR ürününün miktarı, florasan sinyalinin yayılması ile orantılıdır. Her bir reaksiyon döngüsünde ortaya çıkan PCR ürününün miktarı ile orantılı olarak bu sinyal artar.

Spektrofotometrik ölçümler, hazırlanan çözeltiden belirli spektrumlarda ışık geçirilmesi ve bu ışının ne kadarının çözelti tarafından emildiğinin bulunması esasına dayanır. DNA ve RNA çözeltilerinin maksimum emilimi 260 nm'de, protein çözeltilerinin ise 280 nm'de olmaktadır. 260 ve 280 nm (A260/A280) ölçüm aralığındaki oran nükleik asitlerin saflık değerini verir.

Cihaz: ABI 310

ABI 310, kapiler elektroforeze dayalı DNA analizi cihazıdır. Bu cihaz, jel dökme ve örnek yükleme işlemlerini otomatikleştirmektedir. Florasan rengi algılama sistemi ile dizi analizi ve DNA parça analizi işlemleri oldukça kolaylaşmıştır.

61 cm'lik silis (silica) kapiler ile 650 baza kadar DNA dizisi okunabilir ve günde 10 örnek incelenebilir. 45 cm'lik kapiler ile 450-500 baza kadar DNA dizisi okunabilir ve 61 cm'lik kapilere göre işlem süresi örnek başına yaklaşık 1 saat kısalmaktadır.

Agilent 2100 Biyoanalizör mikroakışkan platform teknolojisine dayanan, tek bir platform üzerinde DNA, RNA, protein ve hücre için kantitasyon, boyutlandırma ve kalite kontrolü gibi yöntemlerin yapıldığı bir cihazdır.